Afin de découvrir où il retient son ultime victime, la psychologue Catherine Deane accepte, grâce à un procédé thérapeutique révolutionnaire, de sonder l'esprit déviant de Stargher, un serial killer tombé dans le coma lors de son arrestation. Mais l'univers hostile dans lequel pénètre Catherine va peu à peu altérer sa propre santé mentale...
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L'armée tente encore et toujours de tuer Godzilla, tandis que le Pr Shinoda suit le monstre à la trace pour tenter de percer le secret de son invulnérabilité. Un étrange météore est retrouvé au fond de l'eau et remonté. Le météore ne tarde pas à dévoiler sa vraie nature : un OVNI dont l'occupant s'intéresse de très près au pouvoir régénérateur de G ...
